Galapagos verricht onderzoek naar moleculaire geneesmiddelen en ontwikkelt ze met commercialisatie als uiteindelijk doel. De medicijnen functioneren door kleine moleculen die de oorzaak van ziektes (bepaalde eiwitten) verhinderen.
De ziektes die Galapagos met haar heelmiddelen wil bestrijden zijn onder andere:
- Reumatoïde Artritis
- Psoriasis
- Colitis Ulcerosa (ontsteking dikke darm)
- Idiopathische Pulmonale Fibrose (littekenweefsel op longblaasjes)
Voor de commercialisatie en ontwikkeling van hun meest geavanceerde geneesmiddel Filgotinib werkt Galapagos samen met Gilead, eveneens een farmaceutisch bedrijf, gelegen in de VS. Aan Filgotinib werd al groen licht gegeven om Reumatoïde Artritis te bestrijden, maar het werd recent ook goedgekeurd voor de behandeling van Colitis Ulcerosa. Er loopt daarnaast onderzoek naar het middel als behandeling voor de ziekte van Crohn (een chronische ontsteking van het spijsverteringsstelsel).
Momenteel haalt het bedrijf het merendeel van haar omzet uit de samenwerkingscontracten met Gilead, dat op diverse manieren (cash, aandelen, warrants) investeerde in Galapagos. Zo kon Gilead als enige de rechten verkrijgen op projecten van Galapagos (direct of via opties).